沉寂两年的西蒙大仙终于回归，并且带来了全新一代的变形金刚战士。
在US G1故事结束后，狂派的散兵游勇在雾隐暗丈的领导下在宇宙间流窜，改不了为非作歹的本性。雾隐暗丈甚至结合各个文明的科技，造出一艘全副武装造型超混搭的巨型太空战舰——战界号(Warworld)，驾着它四处横行。获胜的博派也已经人丁凋落，他们回到完成了自我修复的故乡赛伯坦。借助那里的某种神秘力量，行动战士们重新恢复了变形的本领。曾经协助赛星复生并帮助博派获胜的强大元祖战士终极博派不知为何不知去向。不过博派金刚们似乎对此并不在意。他们组织了多个名号响亮的战斗小队，利用灵活方便的传送门技术，在各个星球讨伐残余狂派的暴行，安抚战乱伤痕。在这样的背景之下，Marvel US Transformers G2的故事轰轰烈烈地展开了。
开场时分，一支不明来路的狂派军团正在计划洗劫一颗名叫Nexus Seven的小小星球。编剧们是不是都对7这数字情有独钟呢？当然，博派战士们不会叫他们阴谋得逞。由横炮、探长、刀刃、舷炮组成的“烈火猛攻队”凭空杀出，打得敌人措手不及。狂派好不容易站稳阵脚准备反击，却又赶上机器恐龙驾到，结果一溃千里，兵败如山倒。
博派的胜利并没有令他们赢得原住民的爱戴，却令挨打的狂派队伍恼羞成怒。这支队伍的领袖就是著名的怨念化身灾尔萨斯指挥官。此时他肩上责任沉重——要通过不停地扩张和殖民，在宇宙间复制赛星模式，建立起强大的赛星人帝国。
然后我们走进了OP的梦境。圣人常常通过做梦来得到神的启示。OP自然也不例外。这充满了死亡与毁灭的梦境，仿佛象征着不祥的未来，令他深为担忧。忆往昔峥嵘岁月稠。在OP的回忆中，先后出现了宇宙大帝、雾隐暗丈、G1威震天、震荡波、萨克巨人、惊破天等诸位故人的身影。OP接到钢锁的汇报，率众穿越银河系来到了一颗死亡星球，准备参加一场会议。但迎接他们的却是狂派的疯狂进攻。
打退敌人之后，钢锁方才不紧不慢地现身，接引OP一行来到被攻占的狂派前哨基地。这种先练级再剧情的节奏太像是RPG游戏了。据钢锁的情报，神秘的狂派殖民者已经建造了17颗小型赛伯坦，他们的图谋似乎很不一般。于是钢锁请OP来共同研究敌方行为并制定对策。可惜板凳还没坐热，灾尔萨斯的座驾微光号便将基地化作焦土，并把博派战士们都给抓了起来。
在钢锁的热血劝说下，被噩梦折磨的很消极的OP终于振作起来，领着大家集体越狱，偷船跑路。胜券在握的灾尔萨斯并不慌张，有条不紊地部署了追踪计划。他想借此良机一路跟到博派的老巢，来个斩草除根。
另一方面在地球上，《特种部队 140：一路向南》中的故事正在进行。威震天重现地球，惊动了特种部队的关注，他们火速启动应急预案，联络赛星盟友。不过似乎OP他们并不是在逃跑路上接的这个电话，因为吉祥物大黄蜂并没有出现在这次行动的队伍中。
